Mozilla要讓Firefox市場佔有率成長所將面臨的一個主要的問題會是網頁設計師較傾向於讓程式碼保有與IE的相容性。儘管有網頁標準的存在（主要由W3C組織所推動），但是仍然有許多網頁和應用程式和Firefox等非IE瀏覽器不相容。

為了解決相容性問題，Mozilla計畫僱用專人找出只能用IE瀏覽的網站，並向這些網站的設計師建議如何以標準化的程式方法來撰寫其網頁。

Mozilla定期測試1700流量最大的網站，並且逐一比較它們在IE和Firefox 下的執行情況。該組織的資料顯示，Firefox 能夠與這些網站的網頁保持98% 的相容性，而四年前只有75% 的相容性。